它看起来像是科学的死胡同–一项临床试验没有发现潜在的白血病药物没有益处。但是，就像警察侦探在处理一个寒冷的案件一样，达纳-法伯的科学家收集了数百份用于研究的组织样本-其中大多数在实验室的橱柜中lang发出来，准备处置-并分析了它们的分子组成。

结果是发现了急性髓细胞性白血病（AML）的独特遗传亚型，其预后通常比其他形式差，但富含新的“智能”药物的靶标。这项发表在《 血液 》（ Blood）杂志上的研究证明，如果科学家有远见，可以从基因组时代从肿瘤组织中提取大量信息。

该研究始于2008年，该研究针对患有继发性AML的患者进行了一项新药的国际3期临床试验的启动。在美国，每年有数千人被诊断出该病，它可能是在先前的骨髓恶性肿瘤或其他癌症治疗后出现的。该试验由达纳-法伯（Dana-Farber）的理查德·斯通 （ Richard Stone，MD）共同主持，研究了一种名为阿莫那肽L-苹果酸的新药与阿糖胞苷化疗药物的组合是否比阿糖胞苷和柔红霉素（另一种化疗药物）的标准疗法效果更好。 。全球150个治疗中心的近450位患者被随机分配接受新的或标准的组合治疗。

结果是明确的：新组合在使患者完全缓解方面没有比标准疗法更好（或更差）。

斯通说，疲软的表现结束了阿莫那肽L-苹果酸的临床测试，生产它的公司也开始关闭业务。但是，斯通和达纳·法伯（Dana-Farber）的唐娜·诺伊伯格 （ Donna Neuberg，ScD）并没有让这一特殊的研究工作陷入困境，而是开始讨论什么是科学的抢救行动。

“作为试验的一部分，参与研究的研究中心通常在治疗的不同阶段收集了数百名患者的肿瘤组织样本，” Stone说。 “我们认为，通过收集这种材料并分析其基因组异常，我们可能会了解为什么某些患者对治疗的反应优于其他患者。”

斯通和诺伊伯格向达纳·法伯的同事R. Coleman Lindsley医师（对骨髓增生异常综合症有研究兴趣的医师）问道，他是否认为该计划可行。他说他会调查。

填海研究

Lindsley说，这些组织标本于2012年1月到达20个储存箱中的达纳-法伯（Dana-Farber），“组织得不好，但标签得当”，使他能够将样本追踪到各个患者。将该组织固定在载玻片上，以在显微镜下观察。 Lindsley用剃须刀刮下组织并将每个样品收集在一个单独的小瓶中。他从组织样本中分离出DNA，并分析了其突变。

实验室工作是在林兹利的导师本杰明·艾伯特（Benmin Ebert，MD，PhD）的监督下进行的，并由达纳·法伯癌症研究所之友的赠款和达纳·法伯成人白血病计划的礼物（包括火焰队的礼物） 资助 大众挑战赛和泰德·鲁宾纪念高尔夫锦标赛。

“肿瘤组织样本是一种非凡的资源，”林兹利评论。 “来自五大洲的数百名患者，它们代表了患有这种疾病的人中最好，最具代表性的样本集之一。”

研究人员分析了将近200名研究参与者的肿瘤样本，分为两组：继发性AML（s-AML）（在先前的骨髓癌后发生）和治疗相关的AML（t-AML），在另一种方法治疗后发生癌症。通过将这两种罕见亚型的遗传状况与“从头” AML（一种在没有先前癌症的情况下出现的更常见的变异）的遗传状况进行比较，研究人员确定了s-AML的特定分子特征。

由于从头AML和s-AML通常被区别对待，因此研究人员想知道，新定义的遗传特征是否比标准方法提供了更精确的识别这些亚型的方法。他们分析了由Dana-Farber治疗的105例白血病患者的组织，这些患者的疾病已通过常规方法进行了分类。他们发现三分之一的老年AML患者从头在其肿瘤细胞中带有s-AML信号，并且这些患者的疾病表现得很像s-AML，对化学疗法的反应较差并且有复发的趋势。

“这些发现为鉴定患有这种亚型AML的患者提供了一种客观的方法，并预测了哪些患者最有可能从标准化疗中受益，” Lindsley说。 “它还可以帮助指导我们努力为肿瘤组织带有s-AML特征的患者开发更好的治疗方案。”

Neuberg补充说：“从不成功的临床试验中获取和分析组织的决定表明，科学的学术方法可以补充商业方法。参加临床试验的患者这样做是因为他们的参与可以帮助改善治疗。我们的研究使这种情况得以实现。”