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2007年7月2日，星期一

作为癌症基因组图谱（TCGA）试点项目的一部分，美国国立卫生研究院（NIH）今天授予了八项为期两年的赠款，总计340万美元，以支持创新技术的开发，以探索癌症的基因组基础。

美国国立卫生研究院（NIH）的国家癌症研究所（NCI）和国家人类基因组研究所（NHGRI）于2005年12月宣布进行TCGA试点，以测试一种大规模，系统化的方法来识别人类生殖器疾病发生的变化的可行性。癌细胞的基因组。目的是生成基因组信息，研究团体可以使用这些信息来开发新的和改进的策略，以检测，治疗并最终预防癌症。

该试验中正在研究的肿瘤类型包括脑癌（胶质母细胞瘤），卵巢癌和肺癌（鳞状细胞），在美国每年共占200,000多例癌症。

NCI主任John E. Niederhuber博士说：“除了将生成的详细基因组数据外，TCGA还将非常希望既能促进技术发展又能降低其成本。我们最大的挑战将是应用TCGA将提供有关肿瘤的信息以及NCI从大量患者中收集的基因组数据，以便更好地预测甚至预防癌症的最早发展。”

癌症提出了非常复杂的挑战。数十种癌症中的每一种都可能具有不同的基因组特征或一组特征。 NHGRI主任弗朗西斯·科林斯医学博士说，我们迫切需要与这一任务相称的工具。该研究所的负责人是人类基因组计划的NIH部门。 “我们从人类基因组计划中学到的主要教训之一是技术开发对于成功至关重要。”

选择获得两年资助的机构和主要研究人员是：

• 休斯敦贝勒医学院Aleksandar Milosavljevic博士； $ 413,000；癌症基因组的高通量综合绘图。该项目将开发利用新的高度平行的DNA测序平台研究癌细胞基因组结构变异的方法。

• 希望之城/贝克曼研究所，加利福尼亚杜阿特； Gerd Pfeifer，博士； $ 465,000；癌症基因组中的DNA甲基化。这些研究人员将研究使用1,000个癌细胞在整个基因组中高分辨率分析DNA甲基化的方法。甲基化涉及将甲基基团添加到DNA分子的主链上，可以改变基因与转录机制相互作用的方式，从而使基因开启或关闭。

• 纽约哥伦比亚大学；医学博士本杰明·泰科（Benmin Tycko）； $ 443,000； MSNP进行基因组和表观基因组分析。该团队将致力于使用高密度寡核苷酸阵列来表征基因组畸变和DNA甲基化。寡核苷酸是单链DNA或RNA的短序列，由于它们易于与其互补序列结合，因此常被用作检测互补DNA或RNA的探针。
• 纽约哥伦比亚大学； Timothy Bestor博士； $ 362,000；基因组甲基化模式的高通量分析。这些研究人员将开发用于DNA甲基化的高通量，高分辨率分析的方法。

• 巴尔的摩约翰霍普金斯大学； MPH医学博士Andrew Feinberg； $ 464,000；功能变型。该小组将产生研究等位基因特异性基因表达模式的新方法。研究人员使用术语等位基因来指代基因的变异形式。

• 威斯康星州麦迪逊市的Nimblegen Systems，Inc .；托马斯·阿尔伯特（Thomas Albert）博士； $ 415,000。基因组基因座的大规模选择。该团队将以创新的方式使用高密度寡核苷酸阵列来选择用于DNA序列分析的基因组区域。

• 加州斯坦福的斯坦福大学；罗纳德·戴维斯（Ronald Davis）博士； $ 429,000。癌症突变分析选择器的研制。该项目将开发高通量分离基因组区域以进行DNA序列分析的方法。

• 加州大学戴维斯分校;佩吉·法纳姆（Peggy Farnham）博士； $ 418,000。扩展ChIP芯片分析以改进临床生物标本的分析。这些研究人员将致力于研究方法，利用癌症组织的小片段，对基因组区域中与癌症相关的变化（对基因调控至关重要）进行高通量研究。

技术开发工作将影响TCGA试点项目的其他关键组成部分：三个基因组测序中心，七个癌症基因组表征中心，一个数据协调中心和一个生物样本核心资源。

该试点项目将建立一个公共可用的集成数据库，个人研究人员可以使用该数据库来研究特定癌症的基因组变化，从而为新一代药物和诊断方法开发新的靶标。 TCGA数据将通过NCI癌症生物医学信息网格（caBIG™）和国家医学图书馆国家生物技术信息中心（NCBI）支持的公共数据库提供。 TCGA数据将以符合保护和尊重研究参与者的最高标准的方式提供。

NCI和NHGRI是NIH（美国卫生与公共服务部的一个机构）的27个研究所和中心中的两个。

有关癌症基因组图谱的更多详细信息，请访问http://cancergenome.nih.gov 。

有关癌症和美国国家癌症研究所的更多信息，请访问NCI网站http://www.cancer.gov或致电1-800-4-CANCER（1-800-422-6237）致电NCI癌症信息服务中心）。

有关国家人类基因组研究所的更多信息，请访问NHGRI网站http://www.genome.gov 。

关于美国国立卫生研究院（NIH）：美国国立卫生研究院（NIH）是美国的医学研究机构，包括27个研究所和中心，并且是美国卫生与公共服务部的组成部分。 NIH是进行和支持基础，临床和转化医学研究的主要联邦机构，并且正在调查常见和罕见疾病的病因，治疗方法和治愈方法。有关NIH及其计划的更多信息，请访问www.nih.gov 。

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