新闻发布

2007年5月14日，星期一

飞行和蠕虫模型向研究人员传授人类生物学和医学知识

modENCODE项目定位的所有功能元素。

为了理解生物体发育和繁衍所需的基因组的每个部分，美国国家卫生研究院的国家人类基因组研究所今天宣布了为期四年，价值5700万美元的科学任务的第一笔拨款，以鉴定果蝇和圆虫基因组中的所有功能元件。

这项工作将建立在DNA元素百科全书（ENCODE）联合会的基础上，该联合会正准备建立人类基因组中对生物学功能至关重要的所有元素的全面目录或“零件清单”。除了编码蛋白质的基因外，这些功能元件还包括：非蛋白质编码基因；参与基因转录控制的调控元件；以及介导染色体结构和动态的DNA序列。

“我们在鉴定人类基因组中的功能元件方面取得了长足的进步，但我们对其生物学相关性仍然知之甚少。 NHGRI主任弗朗西斯·科林斯（Francis S. Collins）博士说：“果蝇和蠕虫基因组的这种平行努力将为我们提供有关两种关键模式生物的功能格局的信息，这将有助于我们解决人类中的此类问题。” D．

在过去的几年中，ENCODE研究人员合作开展了一个试点项目，以开发和使用创新的方法和技术在大约1％的人类基因组中发现功能元件。被称为模型有机体ENCODE（modENCODE）的新工作将利用许多这些方法和技术。但是，研究人员不会将其应用到庞大而复杂的人类基因组上，而是将其应用于果蝇（ Drosophila melanogaster ）和圆虫（ Caenorhabditis elegans ）的较小且因此更易于管理的基因组。科学界严重依赖这些模型生物来识别构成人类医学状况的常见基因，蛋白质和过程。

“我们能够提前完成计划并在预算内完成人类基因组计划的主要原因之一是，我们通过对蠕虫和苍蝇等模型生物的较小基因组进行测序学到了很多东西。这项工作使我们能够完善完整分析人类基因组更大序列所需的高通量方法和技术。西雅图的华盛顿大学，以及一位接受modENCODE资助的研究人员。

设计了果蝇和蠕虫modENCODE项目，以便同时研究和分类两种生物中的相似元素。与ENCODE以人为中心的工作不同，modENCODE研究人员还可以在蝇或蠕虫中进行实验，以验证他们确定的功能元件的生物学相关性。通过将蠕虫，苍蝇和人类的数据进行组合和比较，研究人员可以比仅分析一种生物的基因组学到更多有关功能元件的知识。

“苍蝇和蠕虫都与人类有着许多遗传相似性，但是它们的基因组在实验环境中更容易使用。 NHGRI负责ENCODE和modENCODE的计划主任Elise Feingold博士说：“ modENCODE将使我们能够通过精确，快速地操纵蝇和蠕虫基因组，来确认我们在人类基因组中发现了什么。”项目。 “如果DNA序列在从蠕虫到飞行再到人类的整个进化过程中都得到了保守，那么该序列很有可能与功能相关。”

modENCODE研究联盟由专家团队组成，他们带来了许多有关果蝇和round虫生物学的知识。由于数据的复杂性，各个团队将共同努力，以最大限度地提高知识讨论和数据分析的质量。 modENCODE资助的受助人，研究重点和大致的资助水平为：

Susan Celniker，博士，加利福尼亚大学伯克利分校的劳伦斯·伯克利国家实验室— D. melanogaster 。 “果蝇转录组的综合表征”-第一年基金，360万美元；总资金，1450万美元。

史蒂芬·海尼克夫（Steven Henikoff）博士，弗雷德·哈钦森（Fred Hutchinson）西雅图癌症研究中心-秀丽隐杆线虫和黑腹果蝇。 “果蝇和秀丽隐杆线虫的组蛋白变异的全基因组分析”-第一年基金，$ 429,000；总资金，740万美元。

加里·卡彭（Gary Karpen）博士，加州大学伯克利分校劳伦斯·伯克利国家实验室。 — D. melanogaster。 “果蝇中染色体蛋白质的基因组全图绘制”-第一年资金，180万美元；总资金，720万美元。

赖恩（Eric Lai）博士，纽约斯隆·凯特琳研究所纪念斯隆·凯特琳癌症中心。 -D . melanogaster 。 “果蝇基因组中小RNA / microRNA成分的注释”-第一年基金，470,000美元；总资金，190万美元。

Jason Lieb博士，北卡罗来纳大学教堂山分校。 —秀丽隐杆线虫。 “控制秀丽隐杆线虫染色质功能的DNA元素的鉴定”-第一年基金，180万美元；总资金，910万美元。

北卡罗来纳州达勒姆市杜克大学的David MacAlpine博士-D . melanogaster 。 “果蝇复制起源的系统鉴定和分析”-第一年基金，46.9万美元；总资金，190万美元。

纽约纽约大学法比奥·皮亚诺（Fabio Piano）博士。 —秀丽隐杆线虫。 “秀丽隐杆线虫3'UTR及其调控要素大全”-第一年基金，39.7万美元；总资金，160万美元。

迈克尔·斯奈德（Michael Snyder），耶鲁大学博士学位，康涅狄格州纽黑文-C. elegans 。 “秀丽隐杆线虫中转录因子结合位点的全球鉴定”-第一年基金，170万美元；总资金，660万美元。

罗伯特·沃特斯顿，医学博士，华盛顿大学，西雅图。 —秀丽隐杆线虫。 “秀丽隐杆线虫基因组中转录元素的全球鉴定”-第一年基金，140万美元；总资金，540万美元。

凯文·怀特（Kevin White），芝加哥大学博士。 -D . melanogaster 。 “果蝇基因组的顺式监管图”-第一年基金，230万美元；总资金，910万美元。

此外，NHGRI已在四年内每年拨款130万美元用于建立modENCODE数据协调中心，该中心将由林肯·斯坦（Lincoln Stein）博士，医学博士，纽约州冷泉港冷泉港实验室领导。将成为科学界检索由这些项目生成的大量数据的主要门户。 NHGRI已将modENCODE项目指定为社区资源项目，这意味着为该项目生成的所有数据都将在经过实验验证后立即存储在免费的公共数据库中。

有关NHGRI的ENCODE项目的更多信息，请访问www.genome.gov/ENCODE 。

NHGRI是美国国立卫生研究院（NIH）的27个研究所和中心之一，NIH是卫生与公共服务部的一个机构。 NHGRI校外研究部为全国各地的研究，培训和职业发展提供补助。有关NHGRI的其他信息，请访问其网站www.genome.gov 。

关于美国国立卫生研究院（NIH）：美国国立卫生研究院（NIH）是美国的医学研究机构，包括27个研究所和中心，并且是美国卫生与公共服务部的组成部分。 NIH是进行和支持基础，临床和转化医学研究的主要联邦机构，并且正在调查常见和罕见疾病的病因，治疗方法和治愈方法。有关NIH及其计划的更多信息，请访问www.nih.gov 。

NIH…将发现转化为健康®

###