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现已完成2,000种流感病毒基因组的公开发布

新闻发布

2007年2月21日,星期三

对开发治疗和疫苗至关重要的信息。

由美国国立卫生研究院(NIH)之一的国家过敏和传染病研究所(NIAID)资助的流感基因组测序项目今天宣布,它已经取得了重要的里程碑。从世界各地的样本中获取的2,000多种人类和禽流感病毒的完整基因蓝图已经完成,序列数据已在公共数据库中提供。

美国国立卫生研究院主任医师埃利亚斯·A·泽霍尼说:“这些信息将帮助科学家了解流感病毒如何进化和传播,并将有助于开发新的流感疫苗,疗法和诊断方法。”

NIAID主管Anthony S. Fauci博士说:“全世界的科学家可以使用序列数据来比较病毒的不同菌株,确定决定其毒力的遗传因素,并寻找新的治疗,疫苗和诊断靶标。”

流感基因组测序项目始于2004年,已在由NIAID资助的微生物测序中心进行,该中心由马里兰州罗克维尔的基因组研究所(TIGR)管理。最近,不断增长的测序能力使生产率提高到每月超过200个病毒基因组。通过今天的2,000个基因组里程碑,微生物测序中心将继续对更多的流感病毒株和分离株进行快速测序,并将通过GenBank(科学馆和公众维护的互联网可访问数据库)将所有序列数据免费提供给科学界和公众。美国国立卫生研究院国家医学图书馆的国家生物技术信息中心(NCBI),也是该项目的另一主要贡献者。

季节性流感是美国主要的公共卫生问题,每年约有36,000例死亡和200,000例住院治疗。在全球范围内,流感每年导致估计25万至半百万人死亡。季节性流感疫苗每年更新一次,以针对最新的流行病菌株。但是,开发这种疫苗具有挑战性,因为流感病毒在复制时容易发生高突变率,并且这些突变足以改变病毒,以致针对一种菌株的疫苗可能无法针对另一种菌株进行保护。

更加令人担忧的是,可能会在人与人之间轻易传播的新型高致死性病毒株的出现导致流感大流行的可能性。在上个世纪,流感大流行发生了三次,其中最致命的一次是1918年的大流行,据估计造成全世界40至5000万人死亡。

NIAID微生物测序中心的负责人Maria Y. Giovanni博士说:“几年前,在公共领域仅存在关于流感病毒的有限遗传信息,而且许多序列数据是不完整的。”流感基因组测序项目通过大大增加流感序列数据的数量并迅速将其提供给整个科学界来填补了这一空白。随后,全世界范围内将流感基因组序列数据保存到公共领域的科学家人数显着增加,其中包括圣裘德儿童研究医院和疾病控制与预防中心的科学家。”

与NIAID,TIGR和NCBI一起,该项目的其他合作者还包括位于纽约州奥尔巴尼的纽约州卫生部Wadsworth中心;亚特兰大疾病控制与预防中心;田纳西州孟菲斯的圣裘德儿童研究医院;联合国世界动物卫生组织/粮食及农业组织(OIE / FAO)位于意大利帕多瓦的新城疫和禽流感参考实验室;俄亥俄州哥伦布的俄亥俄州立大学;波士顿儿童医院;休斯敦贝勒医学院新西兰基督城的坎特伯雷健康实验室。

有关流感基因组测序项目的更多信息,以及访问流感病毒序列数据的信息,请访问:

为了帮助分析和解释该项目生成的大量序列数据,NIAID资助了BioHealthBase生物信息学资源中心,该中心由达拉斯的德克萨斯大学西南医学中心的研究人员和诺斯罗普·格鲁曼信息技术公司的生命科学开发人员开发马里兰州罗克维尔市的一个部门。该中心为科学界提供了生物信息学和软件工具,以及强大的入口点,可通过用户友好的格式访问流感基因组和相关数据。 BioHealthBase最近与洛斯阿拉莫斯国家实验室的流感序列数据库建立了合作关系,旨在为流感研究人员提供计算数据管理和分析资源,以帮助解释遗传数据。来自流感基因组测序项目的数据以及所有其他可公开获得的流感序列数据,也可以通过NCBI的流感病毒资源获得,该资源包括许多分析工具,例如序列比对和显示进化关系的“树”。

有关这些数据库和其他流感数据分析工具的更多信息,请访问BioHealthBase。

访问PandemicFlu.gov( http://www.pandemicflu.gov/ ),以一站式访问美国政府关于禽流感和大流行性流感的信息。

NIAID是美国国立卫生研究院的组成部分。 NIAID支持基础和应用研究,以预防,诊断和治疗艾滋病毒/艾滋病和其他性传播感染,流感,结核,疟疾和潜在生物恐怖活动媒介等传染病。 NIAID还支持基础免疫学,移植和免疫相关疾病(包括自身免疫性疾病,哮喘和过敏)的研究。可在NIAID网站http://www.niaid.nih.gov上获得新闻稿,情况说明书和其他与NIAID相关的材料。

关于美国国立卫生研究院(NIH):美国国立卫生研究院(NIH)是美国的医学研究机构,包括27个研究所和中心,并且是美国卫生与公共服务部的组成部分。 NIH是进行和支持基础,临床和转化医学研究的主要联邦机构,并且正在调查常见和罕见疾病的病因,治疗方法和治愈方法。有关NIH及其计划的更多信息,请访问www.nih.gov

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