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研究和临床数据汇聚成一体的地方

“在每一个学术机构中,研究数据都是与临床数据相分离的,”医学博士安德森(MD Anderson)总裁罗纳德·德皮尼奥Ronald DePinho)博士说。 “整个机构中,临床数据都被记录在不同系统中的医疗记录和研究数据中。 “通过将研究和临床数据集成到一个系统中,我们正在改变未来的工作方式。”

学术医疗机构产生大量的研究和临床信息。但是使研究人员可以访问这些数据一直是一个问题。

“我们在捕获数据方面做得很好,但最终以不同的方式被保险库,挂锁和监禁,” 博士Andy Futreal博士 ,基因组医学临时主席。 “我们正在尝试进行大数据交换的是将数据释放到一个安全的空间中,在这里我们可以将所有数据放在一起并从中学习。”

来自167,000名患者的数据

作为MD Anderson的Moon Shots计划大数据平台的共同负责人,Futreal和一支专家团队自2012年以来一直致力于建立这样的交流平台。多年的规划促成了2015年系统架构的构建和临床工作的初期加载自2012年1月1日以来接受治疗的167,000名患者的数据。

来自其他两个月球射击平台的研究数据(癌症基因组学实验室的下一代肿瘤遗传分析以及免疫疗法平台收集的血液和肿瘤样本的免疫细胞监测数据)正在添加到大数据交换中。 Futreal说,随着时间的推移,它将扩展到包括其他研究信息。

现在,大多数研究数据分散在MD Anderson的各种数据库中,单个研究人员的计算机硬盘中以及在学术期刊上发表的论文中。

在患者病历中找到的详细临床信息(治疗,副作用,病理学,测试结果,肿瘤学家,外科医生,放射肿瘤学家的注释,图像)将继续保留在MD Anderson的临床电子健康记录(EHR)系统中,同时还会路由进入大数据交换。

从第一天开始,安全和合规专家就参与了该项目,以将保障措施纳入系统。

更多问题,更快答案

Futreal指出,研究人员将能够查询该系统,以“便利和加速对数据的访问,并避免了获取信息所需的费力的搜索,狩猎,收集工作”。

例如,研究特定分子途径的实验室科学家可以在数据库中搜索各种癌症类型之间的特定突变。

或者,肿瘤科医生可能希望查看在特定时间范围内接受特定方案治疗的所有特定类型乳腺癌患者的结局。

Futreal是癌症基因组学方面的专家,并带领团队发现了在所有黑色素瘤病例中发现的BRAF突变。现在,对具有这种突变的患者进行了靶向治疗,该疗法可攻击癌细胞而不损害正常细胞。

Futreal说,但是肿瘤的基因组多样性使他们难以在晚期进行治疗。当靶向疗法击倒依赖于一种突变的细胞时,缺少该突变的存活细胞或已经获得新突变的细胞会复仇。

“由于每种癌症都不相同,我们需要建立这种基础设施,以尽可能多地了解我们所护理的每个患者。一种治疗可以在10位患者中产生10种不同的结果。” Futreal说。 “下次如何做得更好的知识在于那些个体患者。在我们构建能够正确捕获数据,集成数据并对其进行分析的系统之前,我们还缺少一个窍门-一个重要的窍门。”