MD安德森癌症中心的研究人员宣布了一种用于检测单个癌细胞中DNA突变的新方法,而目前的技术只能分析数百万个细胞。他们认为,这一进展可能对癌症的诊断和治疗具有重要的应用。研究结果发表在4月18日的“ 自然方法”在线期刊上。
现有技术被称为下一代测序(NGS),它可以测量数百万个细胞衍生的基因组,而不是用于单细胞测序的新型方法Monovar。由MD Anderson研究人员开发的Monovar可以让科学家检查来自多个单个细胞的数据。这项研究部分是由MD安德森(MD Anderson)的Moon Shots Program ( 月球射击计划)资助的 ,这是史无前例的努力,旨在显着减少癌症死亡人数。
“ NGS技术极大地提高了我们对人类基因组及其在诸如癌症等疾病中的变异的理解,” 肯肯博士 说 。 , 生物信息学和计算生物学助理教授,《自然方法》一书的合著者。 “但是,由于NGS可测量大量细胞,因此组织样本中的基因组变异通常被掩盖。”
这导致了称为单细胞测序(SCS)的较新技术的发展,该技术已在包括癌症研究,神经生物学,微生物学和免疫学在内的许多生物学领域中产生了重大影响,并极大地增进了对癌症某些肿瘤特征的了解。 Monovar进一步改进了新的SCS计算工具,科学家通过更准确地检测称为单核苷酸变异体(SNV)的DNA组成的细微变化,发现了“不足”。
“为了改善SCS数据集中的SNV,我们开发了Monovar,” Nicholas Navin博士说。 , 遗传学助理教授,该论文的合著者。 “ Monovar是一种新颖的统计方法,能够利用来自多个单细胞的数据来发现SNV,并提供高度详细的遗传数据。”
Chen和Navin指出,Monovar将在癌症诊断和治疗,个性化医学和产前遗传学诊断中具有重要的翻译应用,其中准确检测SNV对患者护理至关重要。
对现有技术的这种完善可以很好地促进除癌症以外的许多生物医学领域的研究。研究人员认为,这是评估SCS数据集中SNV的一项重大进展-SNV是多种疾病的关键信息。