MD安德森(MD Anderson)的研究人员发现,胰腺癌肿瘤将完整的DNA和RNA(包裹在保护性脂质颗粒中)释放到血流中时,实质上是在泄漏分子的秘密。根据《肿瘤学年鉴》(Anals of Oncology)的最新在线报告,这使肿瘤成熟,可以进行液体活检分析。
科学家利用血液或其他液体生物样本中循环的外泌体中发现的DNA和RNA对三名患者的肿瘤进行了全基因组,整个外显子组和基因表达分析。
“外泌体DNA和RNA的分析使我们能够做直接进行肿瘤组织活检所能做的所有事情,”资深作者Anirban Maitra,MBBS , 病理学教授,MD安德森氏谢赫·艾哈迈德·本·扎耶德·阿尔·纳哈扬胰腺癌中心主任研究 。
这项研究是MD安德森(MD Anderson)的Moon Shots计划的一部分 ,该计划旨在通过科学知识加速临床发展和预防进展。迈特拉(Maitra)是该计划的12名患者之一的胰腺癌Moon Shot联合负责人。
原理验证研究为液体活检的多种肿瘤类型的验证研究打开了大门,可用于确定预后,指导靶向治疗和监测治疗。
应对胰腺活检挑战迈特拉(Maitra)及其同事发现了多种癌症衍生的生物标志物,包括基因突变,插入,缺失,拷贝数图谱和可以充当新抗原的基因融合体-免疫系统的新靶标。确定了可能的可治疗突变,包括BRCA2和NOTCH1。
分析基因表达他说:“完整的RNA测序很重要,因为基因组测序可以告诉您哪些基因被改变,而RNA分析则可以告诉您实际上正在表达哪些异常基因。” “流离失所的外泌体使我们能够在液体活检中同时进行匹配的DNA和RNA,其分辨率是无细胞方法所不能接受的。”
现在,通常的临床实践仅要求对出现位置较深的肿瘤进行预处理活检。在治疗期间进行活检将更密切地监测治疗的成功或失败,并帮助研究人员更好地了解癌症基因组如何响应治疗而进化。
研究人员指出,外泌体实际上可以更完整地描绘出肿瘤的基因组多样性,因为原发性和转移性肿瘤中存在的所有基因突变都会通过外泌体流入液体活检组织。肿瘤的一部分采样可能仅捕获该区域的突变,而不能反映其整体基因组多样性。
从两名患者的血液样本中分离出外泌体,并在患有肺转移的患者中从胸膜液中分离出外泌体。全基因组测序覆盖了人类基因组的91%,而仅蛋白质编码基因的外显子组测序覆盖了95%至99%。